Ingolstadt II: every transfer in and out, fees paid and earned, squad market value.
| Date | Player | From | To | Fee |
|---|---|---|---|---|
| 2025-07-30 | Luka Klanac | Ingolstadt II | NK Vukovar 1991 | — |
| 2024-08-01 | Michael Udebuluzor | Ingolstadt II | VfR Mannheim | Free |
| 2024-07-01 | Luka Klanac | Ingolstadt U19 | Ingolstadt II | — |
| 2023-07-01 | Michael Udebuluzor | Ingolstadt U19 | Ingolstadt II | — |
| 2023-07-01 | Juan Cabrera | Ingolstadt II | FC Augsburg II | Free |
| 2022-09-06 | Juan Cabrera | Without Club | Ingolstadt II | — |
| 2019-07-01 | Thomas Keller | Ingolstadt II | FC Ingolstadt | — |
| 2018-07-08 | Ryoma Watanabe | Ingolstadt II | Albirex Niigata | — |
| 2018-07-01 | Thomas Keller | Ingolstadt U19 | Ingolstadt II | — |
| 2015-08-26 | Ryoma Watanabe | Waseda Univ. | Ingolstadt II | Free |
| 2014-09-17 | Manuel Ott | Ingolstadt II | Ceres-La Salle | Free |
| 2010-07-01 | Manuel Ott | Ingolstadt U19 | Ingolstadt II | — |