Neptūną Klaipėda (A Lyga): every transfer in and out, fees paid and earned, squad market value.
| Date | Player | From | To | Fee |
|---|---|---|---|---|
| 2026-01-30 | Nojus Luksys | Panevėžys | Neptūną Klaipėda | Loan |
| 2026-01-23 | Daniel Bukel | Panevėžys | Neptūną Klaipėda | Loan |
| 2026-01-01 | Simonas Urbys | Džiugas Telšiai | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2025-07-20 | Yoichi Kawachi | TransINVEST Vilnius | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2025-04-04 | Player | TBC | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2025-02-19 | Armandas Razvadauskas | Neptūną Klaipėda | Banga | Free |
| 2025-02-01 | E. Smulkys | Banga | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2025-02-01 | Aironas Trakselis | Panevėžys | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2025-01-28 | Dmytro Bondar | Neptūną Klaipėda | JK Trans Narva | Free |
| 2025-01-01 | Julius Kasparavičius | Neptūną Klaipėda | Minija | Free |
| 2024-07-01 | Player | Klaipėdos FM | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2024-03-19 | Player | Klaipėdos FM | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2024-03-01 | Player | Klaipėdos FM | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2024-02-01 | Player | FK Riteriai | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2024-01-31 | Player | Neptūną Klaipėda | Karbala | Free |
| 2023-07-13 | Player | Neptūną Klaipėda | Dynamic Herb Cebu | Free |
| 2023-07-03 | Denys Prytykovsky | Neptūną Klaipėda | Super Nova | Free |
| 2023-03-09 | Denys Prytykovsky | Goczałkowice Zdrój | Neptūną Klaipėda | Free |
| 2023-01-20 | Colin Odutayo | Neptūną Klaipėda | FK Riteriai | Free |
| 2022-07-15 | Yegor Smirnov | Neptūną Klaipėda | Super Nova | Free |